降低精子畸形率，通常需要根据病因用药，常见病因包括精索静脉曲张、内分泌异常、弱精子症、畸形精子症等，并且需要根据病因进行用药治疗。

1、精索静脉曲张：对于精索静脉曲张所引起的精子畸形率高，可以使用迈之灵片、地奥司明片等药物进行治疗，能够改善精索静脉曲张，从而降低精子畸形率。当药物治疗效果不理想时，需考虑手术疗法，例如腹腔镜下精索静脉高位结扎术;

2、内分泌异常：例如甲状腺功能亢进，可能会导致体内甲状腺激素水平增高，也可能会影响到精子的质量，从而导致精子畸形率高。患者可使用甲巯咪唑、丙硫氧嘧啶等药物进行治疗，当原发疾病得到控制后，精子畸形率高的情况也会逐渐恢复;

3、弱精子症：可能与精浆生化成分异常、睾丸发育异常等因素有关，也可能会导致精子畸形率高。确诊后可使用生精胶囊、左卡尼汀口服溶液等药物进行调理，并且配合应用硫辛酸片等药物改善生殖功能，可能会使精子畸形率降低;

4、畸形精子症：通常与多种因素有关，例如长期接触化学毒物、大量饮酒、长时间接触放射线等，当精子畸形率较高时，可使用维生素E、枸橼酸氯米芬片等药物进行调理，改善精子畸形率高的情况，使精子正常受孕。

除上述疾病外，还可能为睾丸癌所引起，需考虑进行手术将肿瘤切除，同时配合进行放疗及化疗。