首先，巧克力囊肿可能会影响受孕的机会。囊肿的存在可能导致子宫内膜组织在子宫外生长，影响卵巢功能和卵子的正常释放。这可能导致排卵障碍，从而减少怀孕的机会。此外，巧克力囊肿还可能导致子宫内膜的炎症和粘连，影响受精卵的植入和胚胎的发育。

其次，巧克力囊肿的严重程度和患者的个体差异也会影响怀孕的机会。有些患者可能只有轻度的囊肿，症状较轻，对怀孕的影响相对较小。而对于一些严重的巧克力囊肿患者，可能需要进行手术治疗或才能提高怀孕的机会。

最重要的是，如果您被诊断出巧克力囊肿且希望怀孕，建议咨询专业的不孕不育专家。他们可以评估您的具体情况，确定最合适的治疗方案。