精子畸形率大头小头，可能是不良生活习惯、环境因素、精索静脉曲张、内分泌异常等因素所导致，可能还伴有睾丸坠胀、疼痛等症状。确诊以后应及时进行治疗，包括一般治疗、药物治疗、手术治疗。

1、不良生活习惯：比如长时间饮酒、吸烟，可能会影响到精子生成以及形态，最终导致精子畸形率大头小头，应当调整生活习惯，戒烟戒酒，并且多休息，合理膳食，多进行身体锻炼，通常能够逐渐恢复;

2、环境因素：处于不良的环境当中，频繁接触重金属、有机磷农药等物质，可能会导致精子受到影响，就会导致精子畸形率大头小头，甚至会引起不育，建议改善周围环境，并且遵医嘱口服生精片等药物进行调理;

3、精索静脉曲张：可能与精索静脉回流障碍、静脉瓣功能不全等因素有关，可能会影响到睾丸部位的供血，影响到精子的形态以及功能，就可导致精子畸形率大头小头，严重时还会引起睾丸萎缩以及男性不育。确诊以后可遵医嘱进行手术治疗，例如腹腔镜下精索静脉高位结扎手术;

4、内分泌异常：当体内雄激素缺乏过多时，也会影响到精子的生成以及精子畸形率，导致精子畸形率大头小头，确诊以后应当遵医嘱口服补充雄激素的药物进行调理，例如十一酸睾酮胶囊。