治疗肛肠最好的北京医院可以考虑首都医科大学附属北京肛肠医院、北京协和医院、北京中日友好医院、北京肛肠医院、北京同仁医院等。由于肛肠疾病的复杂性，建议在选择医院时考虑专业水平和患者评价。

1.首都医科大学附属北京肛肠医院

首都医科大学附属北京肛肠医院是北京市的一所三级甲等专科医院，专注于肛肠疾病的诊断与治疗。该医院以其先进的诊疗设备、专业的医疗团队及丰富的临床经验，在肛肠疾病治疗方面享有较高的声誉。

2.北京协和医院

北京协和医院是中国著名的综合性大型教学医院之一，为患者提供全面的医疗服务，其中包括肛肠科服务。医院汇聚了众多国内外知名的专家和学者，他们拥有扎实的理论基础和丰富的实践经验，能够为患者提供高质量的肛肠疾病诊治服务。

3.北京中日友好医院

北京中日友好医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合医院，设有肛肠外科，可满足患者的肛肠疾病诊疗需求。医院拥有一支技术精湛、经验丰富的肛肠外科团队，他们熟练掌握各种肛肠疾病的手术技巧，能够为患者提供安全有效的手术治疗。

4.北京肛肠医院

北京肛肠医院是一家以肛肠病防治为主的专科医院，致力于为患者提供全方位的肛肠健康服务。该医院注重技术创新和人才培养，其领先的微创技术和独特的治疗方法使其成为肛肠疾病治疗领域的佼佼者。

5.北京同仁医院

北京同仁医院是一所历史悠久的综合性医院，设有肛肠科，可以为患者提供肛肠疾病的诊断和治疗服务。医院的肛肠科医生具有扎实的医学知识和丰富的临床经验，能够准确诊断并有效治疗各种类型的肛肠疾病。

选择治疗肛肠疾病的医院时，应考虑医院的专业水平以及是否具备先进的诊疗设备。同时，建议定期进行肛门检查，以便早期发现并处理相关问题。