先天肾萎缩加畸胎瘤是一种先天性发育异常性疾病，是由于单侧或者双侧肾脏出现发育异常，导致一侧肾脏萎缩，另一侧肾脏可正常或者轻度增大，多发畸形，常伴有智力低下、腰痛、血尿等症状。根据病情的严重程度，可以通过药物治疗、手术治疗、透析治疗、肾移植等方式来进行治疗。

1、药物治疗：如果肾萎缩程度较轻，患者没有出现明显的症状，可以在医生的指导下服用百令胶囊、金水宝胶囊等药物来进行治疗，此类药物具有保护肾脏、改善肾脏功能的作用;

2、手术治疗：患者出现肾萎缩的情况时，可在医生的指导下进行手术治疗，如单侧肾切除术、双侧肾切除术等，通过手术治疗可以改善单侧肾脏萎缩的情况;

3、透析治疗：如果先天肾萎缩加畸胎瘤的患者，对侧肾脏功能不全或者出现尿毒症等情况，则可以进行透析治疗，如血液透析、腹膜透析等，通过透析可以维持内环境稳定，也可以改善肾脏功能;

4、肾移植：先天肾萎缩加畸胎瘤的患者，如果疾病发展到终末期，肾脏功能严重衰竭，则可以考虑进行肾移植手术，通过手术将健康的肾脏移植到患者体内，使疾病得到改善。

建议先天肾萎缩加畸胎瘤的患者，及时前往医院的肾内科就诊，完善B超、CT等检查，根据具体病情在医生的指导下进行针对性治疗。畸胎瘤可能是由于遗传因素所导致，可能也会出现腰痛、腹痛等症状，建议及时进行治疗。