新生儿耳聋基因筛查GBJ3突变，说明存在耳聋基因突变的情况。此时需要根据具体情况进行判断，如果为先天性耳聋，则需要进行听力康复训练，如果为后天性耳聋，则需要进行药物治疗。

1、先天性耳聋：新生儿耳聋基因筛查GBJ3突变，可能是由于遗传因素导致的先天性耳聋，此时可能会出现双侧或单侧听力障碍的情况。此时建议在医生指导下使用阿莫西林颗粒、头孢克肟颗粒等药物进行抗感染治疗。同时还需要遵医嘱佩戴助听器，以改善听力；

2、后天性耳聋：如果新生儿出生后出现高热惊厥、脑膜炎等情况，可能会导致新生儿出现耳聋的情况。此时可以在医生指导下使用甲钴胺片、维生素B1片等营养神经的药物进行治疗。必要时可以遵医嘱通过人工耳蜗植入术等方式进行手术治疗；

3、其他情况：如果新生儿出生后出现外伤、颅脑损伤等情况，也可能会导致新生儿出现耳聋的情况。此时可以在医生指导下使用注射用鼠神经生长因子、胞磷胆碱钠胶囊等营养神经的药物进行治疗。必要时也可以遵医嘱通过高压氧的方式进行辅助治疗。

在日常生活中家长要注意新生儿的护理工作，避免让新生儿接触噪音，以免加重病情。