百令胶囊可能会引起肾囊肿。肾囊肿是一种良性病变，主要是由于遗传、感染、外伤等因素导致，如果不及时治疗，可能会影响肾脏的功能，甚至会发展为肾衰竭。

百令胶囊是一种中成药，主要成分是发酵冬虫夏草菌粉，可以起到补肺益肾、填精补肾、养肺止咳的功效，适用于治疗肺肾两虚导致的咳嗽、气喘、咯血、腰背酸痛、面色苍白等症状。从成分上来看，百令胶囊中含有冬虫夏草这种中药材，如果患者长期吃百令胶囊可能会增加肾脏代谢的负担，从而增加肾囊肿的发病几率，所以百令胶囊可能会引起肾囊肿。

另外，百令胶囊在治疗肾囊肿的过程中，如果患者没有按照医生的指导服用，大量的药物进入体内后，可能会增加肾脏负担，久而久之就可能会导致肾囊肿。

如果出现了肾囊肿，一般可以在医生指导下使用金匮肾气丸、桂附地黄丸等药物治疗，也可以通过腹腔镜单侧肾囊肿切除术等手术方式治疗。建议患者到正规医院的肾内科就诊，完善肾脏CT、肾脏MRI等检查明确具体病情。