北京最好的不孕不育医院有北京妇产医院、北京协和医院、北京同仁堂医院、北京301医院、北京积水潭医院等。选择不孕不育医院时，应考虑医院的专业水平、设备设施以及医生的经验和口碑。

1.北京妇产医院

北京妇产医院是专门从事妇科、产科及生殖医学研究的综合性医疗机构。该医院专注于女性健康与生育问题，在不孕不育诊治方面具有丰富的经验。

2.北京协和医院

北京协和医院是中国最早的西医院之一，集医疗、教学、科研于一体。医院拥有先进的设备和技术，能够为患者提供高质量的不孕不育诊疗服务。

3.北京同仁堂医院

北京同仁堂医院是一家以中医药为主，中西医结合的综合医院。该医院注重传统中医与现代技术相结合，对于不孕不育等疑难病症有独到的治疗方法。

4.北京301医院

北京301医院是全军规模最大的综合性三级甲等医院。医院设有生殖医学中心，可为不孕不育患者提供全面的诊断和治疗方案。

5.北京积水潭医院

北京积水潭医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型三级甲等综合医院。该院擅长骨科和创伤外科手术，但同时也包括了不孕不育在内的多个科室。

选择合适的医院进行不孕不育治疗时，应考虑双方的身体状况以及个人意愿，同时关注医院的技术水平和服务质量。