精子畸形率高的婴儿有可能会发生畸形，但几率较小。导致精子畸形率高的原因比较多，如营养不良、环境污染、辐射、遗传等，主要是影响精子的质量，导致精子畸形率高。

1、营养不良：当婴儿处于营养不良的状态时，可能会导致身体的发育受到影响，从而导致精子的畸形率高，影响受精卵的质量，因此要合理地补充营养，多食用富含锌、铁、钙等微量元素的食物，如鸡蛋、瘦肉、牛奶等，并且要均衡饮食;

2、环境污染：如果长时间地处于污染环境当中，比如受到重金属、灰尘等污染，也可能会导致精子的畸形率高，因此应避免吸入有毒有害物质;

3、辐射：当处于电离辐射较大的环境当中时，也可能会影响到精子的质量，导致精子畸形率高，因此需要远离辐射;

4、遗传：精子的畸形率高可能与遗传也有一定的关系，如果父亲或母亲本身的精子畸形率高，可能精子也会畸形率高。

此外，精神压力过大、吸烟、喝酒等不良生活习惯也可能会导致精子畸形率高。为了婴儿的身体健康，建议在备孕期以及孕期尽量避免接触电离辐射、化学污染等不良环境，而且要戒烟戒酒。若已经怀孕，孕妇也要遵医嘱进行定期产检，以便观察胎儿的发育情况。