重庆胃肠医院排名前三的分别是重庆医科大学附属第一医院、重庆医科大学附属第二医院、重庆市第一人民医院。这些医院在胃肠疾病诊断和治疗方面具有丰富的经验和技术优势，可以为患者提供高质量的医疗服务。

1.重庆医科大学附属第一医院

重庆医科大学附属第一医院是重庆地区历史悠久、规模较大的一所综合性医院。该医院在胃肠疾病治疗方面具有丰富的经验和技术优势，且设备先进、医疗团队专业，能够为患者提供高质量的诊疗服务。

2.重庆医科大学附属第二医院

重庆医科大学附属第二医院是一所集医疗、教学、科研于一体的大型综合医院，在胃肠病学领域享有较高的声誉。该医院拥有一支技术精湛、经验丰富的胃肠科专家团队，能够为患者提供全面、个性化的诊疗方案。

3.重庆市第一人民医院

重庆市第一人民医院是重庆市卫生健康委员会直属的一所三级甲等综合医院，其胃肠外科在国内享有较高声誉。该医院拥有先进的医疗设备及一支高水平的胃肠外科医师队伍，能为患者提供优质的手术治疗服务。

4.重庆市第四人民医院

重庆市第四人民医院是一家三级甲等综合医院，设有独立的消化内科，可满足各类胃肠道疾病的诊治需求。该院消化内科在慢性萎缩性胃炎、幽门螺杆菌感染等方面的研究处于国内领先水平，并开展了多项创新性的治疗方法。

5.重庆市中医院

重庆市中医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型中医医院，设有脾胃病科，擅长运用中医药治疗各种胃肠疾病。该医院脾胃病科以传统中药疗法为基础，结合现代医学理念进行个体化调理，对于慢性胃炎、功能性消化不良等病症有较好疗效。

在选择胃肠医院时，应考虑医院的专业特长以及是否具备先进的诊断技术和设备。同时，建议定期进行胃肠健康检查，如胃镜或肠镜检查，早期发现和处理潜在的问题。