做了肛瘘手术后可以遵医嘱使用抗生素类药物、止痛类药物以及抗感染类药物等进行治疗。患者需要根据自身病情的严重程度，在医生指导下选择合适的药物。

一、抗生素类药物

1.抗生素类药物：如果在做完肛瘘手术之后局部伤口出现了炎症反应，并且伴随红肿、疼痛等症状，则可以在医生指导下服用阿莫西林胶囊、头孢克肟片等药物进行治疗，能够起到消炎杀菌的作用，有利于促进伤口愈合。

2.止痛类药物：如果在术后出现剧烈疼痛的情况，则可以在医生指导下服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物进行治疗，能够有效缓解疼痛症状。

二、抗感染类药物

如果术后伤口部位受到细菌感染，可能会导致局部化脓、流脓等情况发生，此时则需遵医嘱口服或外用抗感染类药物进行治疗，如阿奇霉素分散片、盐酸左氧氟沙星胶囊、甲硝唑栓等。

三、其他药物

此外，还可以遵医嘱使用痔疮膏、马应龙麝香痔疮膏等药物来改善不适症状。

建议患者平时要注意个人卫生，保持患处清洁干燥，以免引起感染情况。同时还要注意合理饮食，避免吃辛辣刺激的食物，比如辣椒、花椒等，以免影响身体恢复。若期间出现明显不适，还需及时就医诊治，以免延误病情。