下面通常是指生殖器和肛门，若是生殖器或肛门长小水疱，可能是由于生殖器疱疹、肛周湿疹、毛囊炎、外阴炎等原因引起，建议根据具体情况进行相应的分析。

1、生殖器疱疹：主要是由单纯疱疹病毒感染泌尿生殖器及肛门周围皮肤黏膜而引起的一种炎症性、复发性疾病，主要临床表现是生殖器部位出现小水疱，身体其他部位也可出现小水疱，还会伴有局部瘙痒、疼痛、乏力等不适症状。本病主要以抗病毒治疗为主，常用的抗病毒药物有阿昔洛韦、伐昔洛韦、泛昔洛韦等，需遵医嘱用药，直至水疱结痂或症状消失，在发病期间应注意休息，避免饮酒、食用辛辣刺激食物等;

2、肛周湿疹：本病病因尚不明确，可能与肛肠疾病分泌物的刺激、精神因素、环境因素等有关，会导致肛周出现小水疱、丘疹、丘疱疹或鳞屑等皮损表现，同时伴有不同程度的瘙痒，本病需要就医进行针对性治疗，可遵医嘱使用他克莫司软膏、吡美莫司乳膏1%等进行涂抹治疗;

3、毛囊炎：若是生殖器部位受到细菌感染，可能会引起局部毛囊炎，在局部皮肤出现小水疱的同时，还可能会伴有红色丘疹、瘙痒、疼痛等不适症状，这种情况需要遵医嘱使用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等进行涂抹治疗;

4、外阴炎：本病可能与精神性因素、外阴卫生状况差、糖尿病等有关，可能会引起外阴局部皮肤黏膜肿胀、瘙痒，并伴有局部红疹、烧灼感、水疱等，可遵医嘱口服抗生素药物进行治疗，如甲硝唑、阿莫西林、头孢曲松钠等，也可在医生指导下使用高锰酸钾坐浴，缓解不适。

在日常生活中，需要注意保持生殖器和肛门部位的清洁卫生，避免搔抓，以免出现破溃，引起感染。建议及时就医，在医生的指导下进行治疗，不可私自用药，以免出现不良反应。