南京排名前三的不孕不育医院可以考虑南京医科大学附属妇产医院、江苏省人民医院以及南京市妇幼保健院。这些医院均具备先进的诊疗设备和专业的医疗团队，能够为患者提供全面的不孕不育诊疗服务。

1.南京医科大学附属妇产医院

南京医科大学附属妇产医院是专注于妇科疾病诊治与研究的医疗机构。该医院以先进的医疗设备、精湛的技术水平为患者提供高质量的诊疗服务，因此备受推崇。

2.江苏省人民医院

江苏省人民医院是一家集医疗、教学、科研为一体的大型综合医院，在不孕不育治疗方面具有较高的声誉。医院拥有一支经验丰富的专家团队，他们能够运用前沿技术手段解决各种复杂的不孕不育问题。

3.南京市妇幼保健院

南京市妇幼保健院致力于为妇女儿童提供全方位的健康保障，其中包括不孕不育的诊断与治疗。该院凭借其严谨科学的管理理念及卓越的临床实践能力，在业内树立了良好的口碑。

4.南京鼓楼医院

南京鼓楼医院是历史悠久且规模庞大的综合性医院，设有多个科室，其中生殖医学科可为不孕不育患者提供专业医疗服务。该医院汇聚了一大批高水平的医生和护士，他们拥有丰富的临床经验和扎实的专业知识，能够为患者制定个性化诊疗方案。

5.南京中医药大学附属医院

南京中医药大学附属医院是一所集医疗、教学、科研于一体的综合性中西医结合医院，擅长运用传统中医方法治疗不孕不育等疾病。该医院注重继承发扬中医药特色优势，同时积极引进现代医学新技术新成果，为患者带来安全有效的治疗体验。

选择不孕不育医院时需考虑个人实际情况及预算，确保获得适宜的诊疗服务。建议患者在就医前进行详细的咨询和评估，以利于明确病因并接受针对性治疗。