儿童小便肛门刺痛，可能与尿路感染、痔疮、肛裂、尿道炎有关。建议家长带儿童到医院完善尿常规、肛门指诊等相关检查，明确诊断后再遵医嘱进行治疗。

1、尿路感染：多与儿童不注意个人卫生或长期憋尿等因素有关，可能会导致细菌上行感染，引起尿道炎或膀胱炎，导致儿童小便肛门刺痛。建议遵医嘱服用头孢克洛颗粒、阿莫西林颗粒或者外涂红霉素软膏等药物进行治疗;

2、痔疮：痔疮可导致儿童小便肛门刺痛，多因排便用力导致。症状较轻时可先进行保守治疗，如温水坐浴，以及遵医嘱使用消炎药物，如红霉素软膏、马应龙麝香痔疮膏等。如果症状比较严重，则可能需要通过手术切除痔疮;

3、肛裂：肛裂也可能会导致儿童小便肛门刺痛，多因排便用力过度造成。建议及时到医院进行扩肛治疗，必要时可能需要进行肛裂切除术、肛门内括约肌切断术等手术治疗;

4、尿道炎：一般是由于不注意尿道卫生引起，可导致儿童小便肛门刺痛，还可伴有尿频、尿急等症状。建议及时遵医嘱服用抗生素类药物，如阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等进行治疗。日常还应注意及时更换内裤，保持局部清洁卫生，以免加重病情。

此外，部分儿童如果患有尿道肿瘤，也可能会出现小便肛门刺痛的情况，一般需要通过手术治疗，将肿瘤切除。