检查精子畸形率90%，表明精液当中存在异常情况。可能与不良生活习惯、不良饮食习惯、泌尿生殖系统疾病、遗传等因素有关，可能还伴有睾丸坠胀、疼痛等症状，确诊以后需要进行针对性治疗，包括一般治疗、药物治疗、手术治疗。

1、不良生活习惯：比如长时间手淫、经常熬夜、吸烟、饮酒等，可能会导致精子畸形率过高，建议调整生活习惯，戒烟戒酒，合理休息;

2、不良饮食习惯：比如长期喜欢吃一些生冷食物，易导致身体出现腹泻、腹痛等症状，可能会导致精子当中存在异常，建议改善不良饮食习惯，少食多餐，多吃蔬菜、水果，避免食用辛辣刺激性食物;

3、泌尿生殖系统疾病：比如前列腺炎、精囊炎等，可能导致精子当中存在炎性物质，会影响到精子的质量，就会导致精子畸形率过高，确诊以后应进行药物治疗，如前列腺炎患者可遵医嘱使用阿莫西林胶囊、头孢地尼分散片等药物进行治疗;精囊炎可使用罗红霉素胶囊、阿奇霉素片等抗生素类药物治疗;

4、遗传：当男性存在染色体异常时，也会导致精子畸形率过高，比如染色体平衡易位或者是缺失，就会导致精子的畸形率过高。当检查确诊以后，可考虑进行手术治疗，比如睾丸微创手术;

此外，还可能是睾丸癌引起的，随着肿瘤体积的增大，会侵及周围组织，还会伴有睾丸肿胀等症状。确诊以后应进行手术治疗，如保留睾丸的部分切除术或根治性睾丸切除术。