男子精子畸形率98%不正常，正常情况下精子畸形率应该小于4%。造成精子畸形率高的原因比较多，如长期熬夜、吸烟、饮酒、泌尿生殖系统感染，或者是长期接触化学污染等，建议应该及时到医院就诊检查，明确病因后积极治疗。

1、长期熬夜：长期熬夜有可能会影响到精子的质量，导致精子畸形率高，出现男子精子畸形率98%的情况。建议平时养成良好的作息习惯，不要熬夜，保证充足的睡眠;

2、吸烟、饮酒：香烟当中含有大量的尼古丁以及酒精，长期吸烟饮酒会对精子的质量造成影响，导致精子畸形率高，出现男子精子畸形率98%的情况。建议平时不要吸烟饮酒，应该多锻炼身体，合理作息;

3、泌尿生殖系统感染：如果存在泌尿生殖系统感染，如前列腺炎、精囊炎等，有可能会导致精子的成活率下降，出现男子精子畸形率98%的情况。建议及时到医院做相关检查，可以遵医嘱使用抗生素进行治疗，如阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星片等;

4、长期接触化学污染：如果在工作或者生活中经常接触一些化学污染，比如油漆、甲醛等，有可能会导致染色体畸变，出现男子精子畸形率98%的现象。建议脱离这种环境，或者更换其他的工作环境。