复合乳酸菌肠溶胶囊可以长期服用，但需要在医生或专业人士的指导下进行。

该产品为益生菌制剂，主要用于维持正常肠道菌群平衡，辅助改善腹泻、腹胀等不适症状。因此，患者可以在医生指导下长期服用以达到理想的调理效果。但是，在使用过程中需注意可能出现的不良反应，如过敏、恶心等，并随时观察病情变化，若出现异常应及时停药并向医生咨询。

如果患者对本品中的任何成分存在过敏史，则应避免使用复合乳酸菌肠溶胶囊。

在使用复合乳酸菌肠溶胶囊期间，应注意遵循医嘱调整饮食结构，避免食用可能影响肠道微生态的食物，如抗生素类药物。同时，保持良好的生活习惯，有助于促进身体健康。