胎儿耳朵畸形可能与染色体异常有关。

染色体异常包括21-三体综合征、18-三体综合征等疾病，这些疾病通常伴随着基因突变，导致耳部组织发育不正常，引起耳朵畸形。因此，胎儿出现耳朵畸形时，需要进行染色体检查以确定是否存在染色体异常。

胎儿耳朵畸形还可能是孕期用药不当引起的，如

服用抗癫痫药物或激素类药物，这些药物可能会干扰胚胎发育过程中的细胞分化和生长，导致耳朵结构形成异常。

如果在孕期发现胎儿耳朵畸形，应首先排除染色体异常的可能性，并遵循医生指导完善进一步的遗传咨询和诊断测试。必要时，可考虑进行羊水穿刺或绒毛取样等技术获取胎儿DNA分析。