黄连素可用于治疗肛窦炎。

黄连素能抗多种细菌，包括常见的致病菌如大肠杆菌、痢疾杆菌等，而肛窦炎多因这些细菌感染所致，故可选用黄连素进行治疗。

如果患者对黄连素过敏，则不建议使用。

因为个体差异可能导致药物反应不同，所以需要在医生指导下用药。

需要注意的是，在服用黄连素时不宜与含有鞣质的中药同服，以免形成难溶性复合物，降低药效。同时，黄连素不宜长期大量使用，以防引起肠道菌群失调。