来完月经第三天同房一般不会怀孕。

来完月经后，子宫内膜已经脱落完毕，此时并不具备受精卵着床的条件，而且此阶段并非女性的排卵期，所以怀孕的可能性较低。

如果女性存在月经不规律、多囊卵巢综合征等情况，则可能会影响正常的排卵时间，进而影响怀孕的概率。因此，即使在非排卵期也有可能出现意外怀孕的情况。

建议采取有效的避孕措施以避免意外怀孕的发生，并且注意经期卫生和个人健康维护。若担心有怀孕风险，可适当使用避孕套等工具进行保护。