新生儿甲状腺功能低下经过规范治疗后通常不会复发。

因为该病是由于先天性甲状腺发育不全或者缺如所致，通过药物替代治疗可以有效地促进甲状腺激素水平恢复正常，从而达到治愈的目的。但是需要定期复查甲功以确保病情稳定。

部分患儿在出生时可能处于暂时性的低甲状腺状态，随着生长发育可能会出现甲状腺功能恢复，此时不需要长期用药。

但这种情况较为罕见，需密切监测甲状腺功能变化。

新生儿甲状腺功能低下需及时诊断与治疗，避免潜在并发症发生，并且要关注儿童的心理和社会发展。