新生儿消化不好大便有奶瓣可以考虑使用双歧杆菌、乳酶生、胰蛋白酶、胃蛋白酶、多潘立酮等药物进行治疗。但是新生儿的消化系统发育不完善，用药需谨慎，建议在医师指导下使用药物，并密切观察孩子的症状变化。如果症状持续或加重，应尽快就医以获得适当的治疗。

1.双歧杆菌

双歧杆菌适用于肠道菌群失调引起的腹泻、腹胀。该药能够抑制有害细菌的生长，促进有益菌繁殖，调整肠道微生态平衡。使用时需注意不宜与抗菌药同时服用，以免影响其发挥作用。

2.乳酶生

乳酶生可用于消化不良、肠炎及小儿腹泻等。此药可帮助分解食物中的乳糖和蛋白质，改善消化吸收功能。对于超剂量长期连续使用的安全性尚不明确，因此需要遵医嘱进行用药。

3.胰蛋白酶

胰蛋白酶用于治疗胰腺外分泌不足所致的消化不良。本品能水解多种蛋白，使凝固状态的蛋白质变成熟化状态，从而起到助消化的作用。对本品过敏者禁用，过敏体质者慎用。

4.胃蛋白酶

胃蛋白酶适用于胃液不足引起的食欲缺乏和消化不良。本品能激活胃蛋白酶原，提高胃蛋白酶活性，促进蛋白质分解。本品性状发生改变时禁止使用。

5.多潘立酮

多潘立酮主要用于治疗消化道动力障碍性疾病，如功能性消化不良、慢性浅表性胃炎等。本品通过增强食管下端括约肌张力，促胃肠蠕动，增加LES压力，减少胃内容物返流。早产儿、新生儿禁用；哺乳期妇女应权衡利弊后决定是否应用。

针对新生儿消化不好大便有奶瓣的情况，家长应注意调整配方奶粉，必要时可在医师指导下添加益生菌制剂以改善肠道环境。另外，建议定期监测宝宝体重增长情况，以便及时发现并处理可能存在的营养不良问题。