胃肠功能紊乱可以通过中药调理、腹胀缓解剂、肠道微生物群调节剂、抗抑郁药、抗焦虑药等方法进行治疗。

1.中药调理

中医师会根据患者症状开具汤剂或丸散等中成药，以调和脾胃、理气消积为主要原则。对于轻度至中度胃肠功能紊乱伴有食欲不振、消化不良等症状者有较好效果。

2.腹胀缓解剂

通过口服具有促进胃动力及抑制产气菌活性的药物来减轻腹胀。适用于因功能性消化不良引起的轻微腹胀情况。

3.肠道微生物群调节剂

利用益生菌或益生元补充剂调整体内微生态环境平衡状态。针对改善由肠道菌群失调导致的腹泻、便秘等问题有效果。

4.抗抑郁药

抗抑郁药能够增加5-羟色胺神经递质的浓度，从而达到镇静安神的作用。当胃肠功能紊乱是由精神因素引起时，可以使用抗抑郁药进行治疗。

5.抗焦虑药

抗焦虑药能降低中枢神经系统兴奋性，缓解紧张不安情绪，间接影响胃肠道运动功能。对于存在显著心理压力相关焦虑反应，并伴随明显胃肠道不适现象有益处。

在治疗胃肠功能紊乱的过程中，建议遵循医嘱，合理用药。同时，应保持良好的生活习惯，如规律饮食、适量运动等，有助于改善症状。