新生儿结膜炎不及时治疗可能引起继发性感染，如角膜炎、泪囊炎等，严重时甚至会导致角膜穿孔、失明等并发症。

结膜炎是由各种病原体侵袭结膜所致的一种常见的眼表疾病，由于炎症因子的作用，会导致眼部充血、水肿等症状。如果病情没有得到控制，炎症会进一步发展，向邻近组织蔓延，从而引起其他眼部并发症。此外，当结膜炎伴有鼻泪管阻塞时，易发生泪囊炎，而泪囊炎则为一种化脓性炎症，如果不及时治疗，炎症可能会继续进展，导致角膜受累，进而增加角膜穿孔的风险。

新生儿结膜炎若由细菌感染引起，则可使用妥布霉素滴眼液、盐酸环丙沙星滴眼液等抗生素类药物进行抗感染治疗；若是病毒引起的结膜炎，则需遵医嘱应用更昔洛韦眼用凝胶、重组人干扰素α2b滴眼液等抗病毒药进行处理。

在新生儿患有结膜炎期间，应避免接触刺激性物质，并保持眼部卫生。同时，家长还要注意观察宝宝的症状变化，以便及时发现并处理可能出现的并发症。