严重精子畸形可以通过药物治疗来改善，必要时也可以通过手术的方式来进行处理。
如果精子畸形是由于精索静脉曲张引起的，则需要及时到正规医院通过微创手术的方式进行治疗，从而达到治愈的目的。如果是染色体异常导致的，此时则无法达到根治的效果，只能通过服用五子衍宗丸、生精片等药物进行调理，从而使疾病得到有效的控制。
严重精子畸形可能与内分泌紊乱有关，也可能是感染性疾病所致，如前列腺炎或附睾炎。针对不同的病因，治疗方法有所不同，因此需首先确定具体原因。
在考虑治疗严重精子畸形时，应避免吸烟和酗酒，以减少有害物质对生殖系统的影响。同时，保持均衡饮食，富含锌的食物如牡蛎、核桃可促进精子健康。
