线粒体脑肌病无法完全治愈，但可通过药物治疗和生活方式调整来控制病情发展。
该疾病涉及多种复杂病理机制，其中线粒体功能障碍导致氧化磷酸化缺陷、乳酸积聚及神经递质合成减少，这些异常状态使得目前的医疗手段难以彻底纠正受损的细胞代谢。虽然不能根除病因，但适当的治疗可减轻症状，改善患者的生活质量。
线粒体脑肌病的治疗需个体化制定方案，可能包括营养支持、辅酶Q10等抗氧化剂以及针对特定症状的药物。
患者应定期监测电解质平衡及肌肉功能，并保持均衡饮食以支持线粒体健康。必要时，在专业医师指导下进行适宜的运动锻炼也有助于维持身体状况。
