手足口病和疱疹性咽峡炎的区别在于前者可能伴随口腔溃疡、手部水疱、足底水疱、发热和头痛，而后者主要表现为咽部疼痛、咽峡部疱疹和发热。

1.口腔溃疡

口腔溃疡通常由手足口病病毒侵犯口腔黏膜引起，这些病毒复制后会刺激局部组织，导致炎症反应和溃疡形成。口腔溃疡通常出现在舌头、内颊或其他口腔部位，可能伴有疼痛或灼热感。

2.手部水疱

手足口病是由肠道病毒感染引起的传染病，当病毒通过消化道、呼吸道侵入人体时，会在局部皮肤产生炎症反应，进而出现水疱的症状。水疱多见于手指、手掌、脚趾等处，有时也可见于手指间、指甲周围、足跟边缘等部位。

3.足底水疱

足底水疱的发生与鞋袜摩擦有关，也可能与遗传因素如足底汗腺发达有关。这些因素可能导致足底角质层受损，使水分易于积聚而形成水疱。水疱通常位于足底，大小不一，可伴有瘙痒或疼痛。

4.发热

发热是机体免疫系统对抗感染的一种生理反应，手足口病和疱疹性咽峡炎都属于感染性疾病，在致病因子的作用下，会引起体温调节中枢功能障碍，从而引发发热的现象。发热通常出现在疾病的早期阶段，可能伴随全身不适、食欲减退等症状。

5.头痛

手足口病和疱疹性咽峡炎均存在一定的炎症反应，此时可能会释放出一定量的炎症介质，这些介质作用于神经细胞后，会导致患者出现头痛的情况。头痛可以发生在头部任何位置，但以额部、颞部常见，可能呈钝痛或搏动样疼痛。

针对上述不同症状，建议进行血常规、C-反应蛋白检测以及特定的病毒核酸检测来评估病情。治疗措施包括遵医嘱使用抗病毒药物，如利巴韦林颗粒、磷酸奥司他韦颗粒。患者应注意休息，避免剧烈运动，保持充足睡眠，以促进身体恢复。