肛瘘手术后疼痛一般在3-7天内缓解，具体取决于个体差异、手术方式及是否伴有感染。

肛瘘手术后疼痛通常在术后3-7天内明显缓解，个体差异较大。术后疼痛程度通常与手术部位和大小有关，若手术部位较小且位置表浅，则术后疼痛程度较低，一般在3-5天内缓解。若患者术后出现感染或出现并发症，如肛门狭窄、肛门失禁等，则疼痛持续时间会相应延长，可能需要更长时间的恢复。

术后患者应遵循医嘱，避免剧烈运动，以减少术后疼痛，促进伤口愈合。