气管旁含气囊肿一般不会自行消失。

气管旁含气囊肿是因为胚胎期肺芽发育过程中形成的副支气管或细小支气管闭塞而造成的。这些结构在成年后仍然存在，并且因为没有正常的呼吸功能而逐渐被气体充盈形成囊肿。囊肿内壁由上皮细胞构成，但缺乏平滑肌层，因此不能像正常肺泡那样收缩和扩张，导致囊腔持续存在。虽然囊肿通常不会引起症状，但如果出现感染或其他并发症，需要及时治疗。

此外，如果囊肿伴有感染、出血等情况时，也可能会增大，此时也不会自行消失。

需要注意的是，在观察气管旁含气囊肿是否变化的同时，还要注意是否有相关的临床症状，以免延误病情。