包皮表面出现褐色小疙瘩时，应考虑毛囊炎、扁平苔藓、尖锐湿疣、阴茎癌等可能性。

上述疾病都可能导致生殖器部位的皮肤异常增生或炎症反应，从而形成褐色小疙瘩。由于不同疾病的病因、临床表现及处理方式各不相同，因此需要专业医生评估后确诊并给予相应治疗。

如果患者有长期吸烟史，烟草中的尼古丁也可能会导致色素沉着，使包皮表面出现褐色小疙瘩。这是因为尼古丁具有刺激性，可引起局部血管收缩和血液循环障碍，进而引发色素沉着。

在诊断包皮表面褐色小疙瘩的具体原因前，应避免自行搔抓或挤压病变区域以防感染扩散或加重病情。同时建议患者注意个人卫生，保持患处干燥清洁，以减少不适症状的发生。