睡觉起来肩胛骨后背疼痛并伴随呼吸困难可能是睡眠姿势不当、枕头过高引起的，也可能是胸椎间盘突出、胸膜炎、肺栓塞等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便进行针对性治疗。
1.睡眠姿势不当
睡眠姿势不当可能导致肌肉紧张和血液循环不畅，从而引起肩胛骨后背疼痛。调整睡眠姿势，使用合适的床垫和枕头可以缓解疼痛。例如，使用较硬的床垫和低枕头有助于改善睡眠姿势。
2.枕头过高
枕头过高会使颈部处于过度伸展状态，导致颈椎受压而出现肩背部酸痛的症状。建议选择合适高度的枕头以支撑颈部，减轻不适感。如适当降低枕头高度或将枕头放置于头部下方以减少对颈部的压力。
3.胸椎间盘突出
胸椎间盘突出时，突出的间盘组织可能会压迫邻近神经根，引起肩胛骨后背区域的放射性疼痛、麻木等症状。非手术疗法包括物理治疗、穿戴支具等，必要时可遵医嘱服用布洛芬缓释胶囊、双氯芬酸钠肠溶片等药物进行止痛处理。
4.胸膜炎
胸膜炎是由多种原因引起的胸膜壁炎症反应，炎症刺激周围组织，进而诱发肩胛骨后背疼痛的现象发生。患者可在医生指导下使用阿莫西林胶囊、头孢克肟颗粒等抗生素类药物控制感染，从而达到治愈的目的。
5.肺栓塞
肺栓塞是指血流中凝固块阻塞肺动脉及其分支，使肺循环发生障碍的一种急症，由于肺血管痉挛收缩和微血管栓塞，会导致胸闷、气促、咳嗽以及肩胛骨后背疼痛的情况发生。肺栓塞的治疗需要紧急处理，通常采用抗凝治疗，如遵照医师意见给予依诺肝素钠注射液、华法林钠片等药物进行抗凝治疗。
针对肩胛骨后背疼痛的呼吸困难，应尽快就医以便进行胸部X光、CT扫描或MRI以评估肺部状况。同时，注意休息，避免剧烈运动，以免加重背部负担。
