肠胃菌群失调大便发黑可能是由于缺铁性贫血引起的。

因为肠胃菌群失调会影响食物的消化吸收，可能会导致铁元素吸收不足，从而引起缺铁性贫血。当体内缺乏铁元素时，造血干细胞无法正常合成血红蛋白，血液中的血红蛋白数量减少，运输氧气的能力也会降低，因此会出现贫血的症状，如面色苍白、乏力等。同时，为了弥补铁元素的不足，骨髓会加速生成新的红细胞，这些红细胞在成熟过程中会破裂，释放出大量的含铁血黄素，随着排泄物一起排出体外，从而使大便呈现黑色。

此外，如果患者长期存在慢性炎症或感染性疾病，也有可能会引起上述症状。这主要是因为持续的炎症反应会导致黏膜组织受损，进而影响到正常的消化功能，使食物中的血红蛋白不能被充分分解和吸收，而是以原形随粪便排出，从而出现大便颜色异常的现象。

针对肠胃菌群失调和缺铁性贫血等问题，建议患者调整饮食结构，增加富含益生菌的食物摄入，如酸奶、发酵豆制品等，有助于改善肠道微生态环境。对于缺铁性贫血，可以通过口服铁剂来补铁治疗，如硫酸亚铁片、富马酸亚铁片等。