肺念珠菌病的严重程度因人而异，通常取决于感染范围、治疗及时性和患者免疫状态。
轻度感染时，机体免疫系统能够有效控制念珠菌的生长繁殖，防止进一步扩散。此时症状较轻，预后较好，一般不会引起严重的并发症。若未得到及时有效的治疗，念珠菌会持续繁殖，破坏肺组织，引发急性肺炎、肺脓肿等严重并发症，进而加重病情，甚至威胁生命安全。
存在慢性疾病或长期使用免疫抑制剂的个体，由于免疫力低下，可能导致感染难以控制，从而导致病情恶化。
在诊断为肺念珠菌病后，应尽快开始抗真菌药物治疗以减少器官损害风险。同时，患者应注意休息，避免过度劳累，保持良好的营养状况，有助于增强机体抵抗力，促进康复。
