咽部粘液囊肿一般不严重，多为良性疾病，可通过药物治疗、手术治疗等方式进行处理。

咽部粘液囊肿主要是由于局部炎症刺激引起的淋巴滤泡增生，会导致出现异物感、咳嗽等症状。其属于良性病变，因此病情并不严重。患者可在医生指导下使用复方氯己定含漱液、复方硼砂含漱液等药物缓解不适症状，必要时也可通过扁桃体挤切术、舌根扁桃体切除术等手术方式来改善病情。

如果囊肿较大或伴有感染，可能需要进一步观察或抗生素治疗，如阿莫西林克拉维酸钾片、头孢克肟胶囊等。

在诊断咽部粘液囊肿时，应排除恶性肿瘤的可能性，以免延误治疗。同时建议定期复查，监测病情变化，保持良好的口腔卫生习惯，避免吸烟和酗酒。