肛门镜一般是指肛门直肠镜，是检查肛门直肠疾病的重要手段，肛门指检和肛门镜检查不一样，二者的主要区别在于检查途径、检查方法、检查目的、检查费用等方面。
1、检查途径：肛门指检是通过肛门指检，即医生将食指戴指套或者手套，伸入肛门的内部进行触诊，大致可以感知距肛缘一指长的肛门和直肠有无病变;而肛门镜是通过肛门镜，即通过手指或者仪器，将肛门口周围组织放大10-40倍，观察直肠和肛门的病变;
2、检查方法：肛门指检主要是将食指放在肛门内，进行退出检查;而肛门镜是将探头从肛门处伸入，通过退镜检查可以明确整个大肠的情况;
3、检查目的：肛门指检主要是为了检查直肠内是否有肿瘤、息肉等器质性病变，如果直肠内有占位性病变，可以通过肛门镜明确肿瘤的大小、位置、数目等;
4、检查费用：肛门指检的费用相对较低，但由于肛门指检需要进行手法操作，因此可能会产生一定不适感;而肛门镜检查费用相对较高，在临床上，一般建议采取无痛性检查，以减少患者的不适感。
除上述区别外，二者还存在指检范围、能够观察到的疾病范围等方面。如果患者存在肛肠类疾病，可以在医生的指导下选择合适的方法进行检查。
