会厌囊肿一般不会自行消失，需要通过手术切除的方式进行处理。

会厌囊肿主要是由于会厌黏膜下的黏液腺导管堵塞导致分泌物潴留而形成，如果不及时处理，可能会导致病情加重，甚至诱发吞咽困难、呼吸不畅等症状，严重者可影响生活质量，所以需要通过手术切除的方式进行治疗。

如果患者存在局部感染，可能引起炎症反应，导致会厌囊肿出现红肿、疼痛等不适症状。此时需遵医嘱使用抗生素治疗，如头孢克肟、阿莫西林克拉维酸钾等药物控制感染后再行手术。

在临床上，对于会厌囊肿的诊断通常需要借助电子喉镜检查明确具体情况。此外，建议定期复查以监测病情变化，如有不适症状应及时就医。