新生儿免疫缺陷可以考虑采取胸腺移植、骨髓移植、脐带血移植、基因治疗、免疫球蛋白替代疗法等方法进行治疗。

1.胸腺移植

胸腺是T细胞发育成熟的重要场所，通过恢复胸腺功能来改善机体的免疫状态。适用于选择性IgA缺乏症等无法产生足量抗体的患者。

2.骨髓移植

骨髓中含有造血干细胞，可以分化为各种免疫细胞，骨髓移植可重建患者的免疫系统。

主要针对遗传性免疫缺陷、重度联合免疫缺陷等疾病。

3.脐带血移植

脐带血含有丰富的造血干细胞，可以用于补充患者缺失的免疫细胞。对于先天性无丙种球蛋白血症等先天性免疫缺陷有较好的效果。

4.基因治疗

通过引入正常基因到患者体内，纠正或补偿缺失或异常的功能，以达到治愈的目的。主要用于囊性纤维化、严重联合免疫缺陷病等单基因缺陷导致的免疫缺陷。

5.免疫球蛋白替代疗法

免疫球蛋白是血液制品，能够提供暂时性的被动保护，帮助对抗感染。适合于新生儿期出现的暂时性免疫缺陷，如继发性免疫缺陷综合征。

新生儿免疫缺陷需在专业医生指导下进行个体化治疗，同时应密切监测病情变化及可能出现的并发症。定期评估患儿的生长发育情况以及感染风险，并根据需要调整管理策略，确保其获得比较好健康状况。