肛门指检后第二天小腹疼，可能由于手法过于粗暴、肠道感染、痔疮、肠痉挛等原因所导致，需要及时就医，并根据检查结果进行相应治疗。
1、手法过于粗暴：肛门指检时如果手法过于粗暴，可能会导致括约肌受到损伤，出现肛门指检后第二天小腹疼的现象。此时需要多休息，症状会逐渐缓解，必要时可以服用止痛药物治疗，比如布洛芬缓释胶囊等;
2、肠道感染：如果在肛门指检后没有注意做好局部护理，可能会导致肠道受到细菌感染，细菌侵袭肠道可能会引起肠道痉挛，从而出现肛门指检后第二天小腹疼的现象。此时可以遵医嘱服用抗炎药物进行治疗，比如阿莫西林胶囊、盐酸左氧氟沙星胶囊等;
3、痔疮：如果患者存在痔疮，在肛门指检时可能会刺激痔疮，导致肛门指检后第二天小腹疼的情况。此时建议及时到医院就医，并遵医嘱使用痔疮栓等药物治疗。如果痔疮较为严重，应及时进行切除手术治疗;
4、肠痉挛：如果在肛门指检时情绪过于紧张，可能会导致肛门括约肌受到刺激而发生痉挛，从而出现肛门指检后第二天小腹疼的情况。此时可以通过热敷、按摩等物理治疗缓解症状，必要时可以服用解痉止痛药物治疗，比如颠茄片等。
建议患者到医院完善相关检查后再进行治疗，平时需要注意不要久坐、久站，适当多喝水，并且注意饮食清淡，避免进食辛辣、刺激性食物。另外，还应该保持良好的排便习惯，排便时不要过于用力。
