卵泡囊肿萎缩后一般会排卵。

卵泡囊肿是卵泡发育过程中的一个阶段，通常会在一定时间内自然消退，不会对正常的卵泡发育和排卵产生影响。因此，在囊肿萎缩后，卵泡会继续发育并达到成熟状态，然后释放卵子进行排卵。

如果患者有生育计划，建议在此期间密切关注身体变化，及时咨询医生，以确保身体健康和顺利怀孕。

对于黄体期形成的卵泡囊肿，由于激素水平的变化，囊肿可能会自行消失，但并不意味着一定会排卵。

针对卵泡囊肿的监测以及月经周期的追踪是非常重要的，建议定期进行超声检查以评估囊肿的变化，并采取适当的治疗措施。