新生儿呼吸衰竭是否会有后遗症因人而异。
后遗症的发生与呼吸衰竭的原因及严重程度有关，对于轻度的新生儿呼吸衰竭，其病因可能是暂时性的，例如羊水吸入或胎粪污染呼吸道，通常不会造成性的器官损伤，一般也不会留下后遗症。但如果是由严重的遗传代谢疾病引起的，则可能导致神经系统或其他器官的功能受损，从而增加出现长期并发症的风险。
新生儿呼吸衰竭可能伴随的并发症包括肺动脉高压、脑水肿等，这些并发症也可能会导致长期的健康问题。
在关注新生儿呼吸衰竭的同时，应定期监测任何潜在的后遗症，并确保提供适当的护理和支持以促进比较好预后。
