肛门有肉瘤且疼痛时，应考虑痔核脱出、血栓性外痔、肛周脓肿、直肠癌等疾病的可能性，建议及时就医明确诊断。

上述提及的疾病都可能会引发肛门部位出现肉芽肿块，并伴随不同程度的疼痛症状。如果患者无法自行辨别病因，或者疼痛加剧，应及时就医以便获得专业的评估和治疗。

除了上述提及的可能原因外，还应注意排除结核病、恶性肿瘤引起的淋巴结转移等情况。这些疾病也可能导致肛门周围出现异常肿物，并引起疼痛，但其临床表现和处理方式与前述疾病有所不同。

在面对肛门疼痛伴有肉瘤的症状时，应避免过度用力排便或擦拭，以减少局部刺激。同时保持肛周清洁干燥，穿着宽松透气的内裤也有助于缓解不适。