睡觉起来眼球疼可能是睡眠姿势不当导致压迫、眼表异物、干眼症、角膜炎、结膜炎等引起的，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，明确诊断。

1.睡眠姿势不当导致压迫

睡眠时长时间保持一个姿势会导致眼部肌肉和软组织受到压迫，血液循环受阻，从而引起眼部疼痛。调整睡眠姿势，避免长时间保持同一姿势，可以减轻眼部压力，缓解疼痛。

2.眼表异物

眼表异物是指外来物质进入眼睛表面，刺激结膜囊黏膜，导致眼部不适、疼痛等症状。使用生理盐水冲洗眼睛，以清除异物。必要时可遵医嘱使用抗生素眼药膏预防感染。

3.干眼症

干眼症是由于泪液分泌不足或蒸发过快导致的眼部干燥，出现眼睛疼痛、灼热感等不适症状。应用人工泪液滴眼液来缓解症状，如玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等。

4.角膜炎

角膜炎是由细菌、真菌或其他病原体侵入角膜所引起的炎症反应，通常伴随眼部疼痛、畏光、流泪等症状。针对不同类型的角膜炎，需遵医嘱选用相应的抗微生物药物进行治疗，如妥布霉素滴眼液、氟康唑滴眼液等。

5.结膜炎

结膜炎由病毒、细菌、过敏等因素引起结膜充血、水肿，炎症因子刺激眼部神经，引起眼部疼痛。结膜炎的治疗需要根据病因选择合适的方法，如遵医嘱用红霉素眼膏、氯霉素滴眼液等外用药膏进行局部涂抹。

建议定期进行眼科检查，包括视力测试、裂隙灯检查以及眼压测量，以便及时发现并处理相关问题。注意保持良好的睡眠姿势，避免过度疲劳，有助于减少眼部不适的发生。