胚胎停止发育三个月后才发现是不正常的。

胚胎停止发育后，体内激素水平会发生变化，可能导致月经推迟或者不规律，进而影响到排卵时间。如果在此期间仍然存在生育需求，则需要进行详细的妇科检查以及相关实验室检测以评估子宫内膜厚度是否适合着床，并监测是否存在黄体功能不足等问题。此外还要注意保持良好的生活习惯，如戒烟限酒、合理饮食及适量运动等，有助于提高受孕成功率。

胚胎停止发育三个月后才发现可能与孕妇自身免疫状态异常有关，也可能是染色体异常导致的。

面对胎停现象，建议孕妇应避免过度焦虑或紧张，以免加重心理压力。同时要定期复查，以便及时发现并处理任何潜在的问题。