单只眼球充血眨眼疼可能是角膜炎、结膜炎、干眼症、睑缘炎、倒睫等疾病的表现，这些疾病都可能导致眼部不适和疼痛。建议患者及时就医以确定具体病因，并接受相应治疗。

1.角膜炎

角膜炎是由各种病原体感染引起的角膜炎症反应，导致角膜上皮细胞损伤和水肿，引起眼部疼痛、畏光、流泪等不适症状。患者可在医生指导下使用妥布霉素滴眼液进行抗感染治疗。

2.结膜炎

结膜炎通常由病毒、细菌或其他微生物感染引起，这些病原体侵袭结膜组织，导致结膜血管扩张和分泌物增多。当炎症刺激到神经末梢时，就会出现眼部疼痛的症状。对于细菌性结膜炎，可遵医嘱使用左氧氟沙星滴眼液进行抗感染治疗。

3.干眼症

干眼症是由于泪液量减少或质量下降导致的眼表干燥，使角膜失去润滑保护而产生疼痛感。患者可以遵照医生的指导使用玻璃酸钠滴眼液、聚乙烯醇滴眼液等人工泪液缓解症状。

4.睑缘炎

睑缘炎是指睑缘部位发生的慢性炎症，炎症因子刺激会导致眼皮肿胀、疼痛等症状。患者可以在医生指导下局部涂抹抗生素药膏如红霉素眼膏以控制感染。

5.倒睫

倒睫指的是睫毛生长方向异常，部分甚至直指眼球，摩擦角膜和结膜，从而诱发炎症反应，出现眼部充血、疼痛的情况。如果仅有一两根倒睫，可通过电解法将毛囊破坏；若为多根倒睫，则需考虑手术矫正。

建议定期进行眼科检查，包括视力测试、裂隙灯检查以及眼压测量，以监测眼部健康状况。保持良好的眼部卫生习惯，避免用手揉搓受感染的眼睛，有助于预防相关疾病的发生。