肛门指检是检查直肠的一种方法，如果肛门指检很疼，可能与患者的痛觉敏感，以及肛门存在疾病，比如肛裂、痔疮、肛窦炎等有关，通常需要进行热身活动、坐浴、药物治疗、手术治疗等方式来进行处理。
1、热身活动：如果患者不进行麻醉，则可以先进行肛门周围的热身活动，比如做缩肛运动或者提肛运动，可以帮助放松肛门括约肌，降低肛门的敏感性，从而可以缓解疼痛的症状;
2、坐浴：进行坐浴时，应注意水温不宜过高，建议在40°C以下，并且应注意坐浴前后的卫生清洁，最好是用淋浴头进行坐浴。通过坐浴可以使肛门括约肌得到一定的放松，从而可以帮助缓解疼痛;
3、药物治疗：如果患者存在肛裂或者痔疮，则可以遵医嘱使用止疼药物进行治疗，比如双氯芬酸钠栓、布洛芬乳膏等。另外，还可以使用复方角菜酸酯栓等药物，可以缓解肛门局部的疼痛、肿胀等症状;
4、手术治疗：如果患者肛裂症状比较严重，通过热身活动和坐浴、药物治疗都不能得到缓解，则应及时到医院就诊，可以进行手术治疗，比如皮肤-黏膜缝合术、内括约肌侧切术等。如果患者存在痔疮，则应根据情况选择手术方式进行治疗，如血栓性外痔摘除术、吻合器痔上黏膜环切术等。
如果患者进行肛门指检后出现疼痛，建议及时根据医生建议进行治疗。在日常生活中，建议定期进行体检，了解近期的身体状况，如果出现异常可以做到早发现、早治疗。除此之外，建议患者养成比较良好的排便习惯，比如每天按时排便等。
