嗓子疼舌头根疼可能是急性咽炎、急性扁桃体炎、舌咽神经痛、咽部异物感、咽喉反流等疾病的表现，需根据具体因素进行针对性治疗。建议患者及时就医，以便获得适当的诊断和治疗。

1.急性咽炎

急性咽炎是由病毒、细菌感染引起的咽黏膜、黏膜下组织及其淋巴组织的急性炎症。此时由于炎症刺激会导致局部出现疼痛的情况。患者可遵医嘱使用复方氯己定含漱液进行缓解。

2.急性扁桃体炎

急性扁桃体炎通常由病毒或细菌感染引起，导致扁桃体充血肿胀，当炎症累及到扁桃体周围的组织时，就会引起喉咙和舌头根部疼痛的症状。对于细菌性急性扁桃体炎，医生可能会开具抗生素治疗，如青霉素或者头孢菌素类药物。

3.舌咽神经痛

舌咽神经痛是舌咽神经分布区域内的阵发性剧烈疼痛，这种疼痛可能辐射至喉咙和舌头根部，引起这些部位的不适或疼痛。针对舌咽神经痛的治疗方法包括口服药物治疗，如卡马西平、苯妥英钠等；若药物无效，可考虑微创手术治疗，如经皮穿刺三叉神经射频电凝术。

4.咽部异物感

咽部异感症是指咽喉部没有器质性病变却有各种异常感觉的一组症状群，如果异物感持续存在并伴有轻微疼痛，则可能导致患者感到喉咙和舌头根部疼痛。建议患者可以尝试用淡盐水漱口来缓解疼痛症状。

5.咽喉反流

咽喉反流是一种消化道疾病，胃内容物通过食管上括约肌逆向流入咽喉部，对咽喉黏膜造成刺激而引发疼痛。患者可在医师指导下服用抑酸药改善病情，如奥美拉唑、雷贝拉唑钠等。

建议患者定期进行喉镜检查以及颈部超声波检查，以监测病情变化。饮食方面宜清淡，避免食用辛辣刺激性食物，以免加重疼痛症状。