男性患者出现尿痛、尿黄及小便时的刺痛感可能是由于存在尿路感染。

尿路感染是由细菌侵入泌尿系统引起的炎症反应，如大肠埃希菌、变形杆菌等。这些病原体在繁殖过程中会产生毒素和代谢产物，导致尿液颜色改变为黄色，并刺激尿道黏膜，引发尿痛和灼热感。同时，尿路感染还会引起尿频、尿急等不适症状。确诊需进行尿常规、尿培养等检验。治疗多采用抗生素治疗，如环丙沙星、诺氟沙星等。

如果患者的症状持续不缓解或伴有发热、腰痛等症状，则可能为急性肾盂肾炎。此时需要及时就医以获得适当的诊断和治疗。

日常生活中应保持良好的个人卫生习惯，尤其是阴部清洁，避免过度使用化学物质刺激尿道口，以免诱发或加重上述症状。