肛门指检不能确定复杂的肛瘘时，可以考虑使用肛门镜检查。

肛门指检是医生戴手套后将食指伸入患者肛门内触摸检查的一种简便方法，但对复杂肛瘘的诊断有一定局限性。而肛门镜检查则能直接观察到肛管内部结构，包括是否存在异常管道等，从而帮助确诊复杂肛瘘。

如果发现有明显的疼痛、红肿等症状，则可能是肛周脓肿或肛裂等问题导致的，此时需要进一步通过影像学检查来明确诊断。

在诊断肛瘘的过程中，应注意避免肛门局部感染加重，以免影响病情判断。同时还要注意保持良好的生活习惯，避免久坐或过度劳累，以减轻症状。