小儿疱疹性咽峡炎患者可在医生指导下使用干扰素进行治疗。

因为干扰素是一种广谱抗病毒药物，能够抑制多种DNA和RNA病毒的复制，从而起到抗病毒的作用。本药可用于治疗由肠道病毒感染所致的小儿疱疹性咽峡炎，因此可遵医嘱使用。

如果患儿存在免疫缺陷或正在接受免疫抑制治疗，则可能无法有效对抗感染，此时需谨慎使用干扰素，并密切监测病情变化。

在治疗小儿疱疹性咽峡炎的过程中，应避免过度使用抗生素以防耐药性的产生，同时注意休息、保证充足水分摄入以促进恢复。