三个月宝宝牙龈上长个白疙瘩可能是马牙或者滞留的牙胚组织。

马牙通常是由未完全退化的胚胎残余组织形成的，一般不需要特殊处理，会自行脱落；滞留的牙胚组织则是因为恒牙胚在发育过程中未能正确替换乳牙导致的，需要及时就医进行专业处理。这两种情况都属于较为常见的儿童口腔问题，但并不意味着可以忽视，因为它们可能对孩子的咀嚼、吞咽甚至发音造成影响，因此需密切关注并妥善处理。

此外，还应考虑是否为鹅口疮或舌苔过厚所致。这些疾病也可能会引起白色斑点样病变，但其病因与上述有所不同，治疗方式也有异。

家长应注意观察孩子口腔内变化，避免使用硬质食物摩擦患处，并保持良好的口腔卫生习惯。若发现白疙瘩有增大、疼痛等症状时，应及时带孩子到医院就诊。